Cientistas publicam o primeiro atlas genómico global da vida microscópica dos lagos

Uma equipa internacional de investigação publicou o primeiro atlas genómico global dos organismos microscópicos encontrados em lagos e albufeiras, noticiou o Phys.org a 7 de outubro. A equipa analisou 3 400 conjuntos de dados de ADN de 362 lagos e albufeiras em 28 países de todos os continentes. Os resultados foram publicados na Nature Communications.

Os investigadores reconstruíram quase 20 000 genomas mitocondriais de cerca de 3 660 espécies, noticiou o Phys.org. As mitocôndrias são as estruturas dentro das células que produzem a maior parte da sua energia. Para vários grupos de algas e organismos relacionados, a equipa identificou entre seis e mais de 20 vezes mais espécies do que as atualmente listadas na principal base de dados genómica de referência mundial.

Menos de um em cada 20 genomas pôde ser atribuído a um género conhecido, um grupo de classificação acima da espécie, e cerca de 750 espécies não puderam ser associadas a nenhum grupo conhecido, segundo o estudo. «Isto mostra quão grandes são ainda as lacunas no nosso conhecimento», afirmou o autor principal, Lucas Serra Moncadas. Disse que grande parte da biodiversidade que mantém os lagos a funcionar permaneceu oculta e nunca foi documentada.

Adrian-Stefan Andrei, responsável pelo grupo de Evogenómica Microbiana da Estação Limnológica da Universidade de Zurique, afirmou que uma alga inofensiva e o seu parente tóxico podem parecer idênticos ao microscópio, e que o seu ADN provavelmente contém a chave para os distinguir. O método utilizado no estudo começa com uma amostra de água. A água é filtrada, e todo o ADN retido no filtro é lido de uma só vez num processo designado sequenciação, segundo o Phys.org. Uma ferramenta de aprendizagem automática identifica depois o ADN das mitocôndrias, cujo genoma é pequeno e, em geral, muda mais rapidamente ao longo do tempo evolutivo do que o ADN no núcleo da célula.

A equipa estabeleceu um limiar claro para que as espécies possam ser identificadas de forma consistente em diferentes lagos, estações e estudos, noticiou o Phys.org. Segundo o relatório, o atlas lança as bases para uma monitorização mais rápida e mais precisa dos lagos.

Durante décadas, estes organismos foram monitorizados contando-os um a um ao microscópio com um método desenvolvido em 1958, noticiou o Phys.org. O processo é lento, depende de conhecimentos especializados que se estão a tornar cada vez mais escassos e tem um importante ponto cego, segundo o relatório. Em 2022, uma floração de uma microalga tóxica no rio Oder, na fronteira germano-polaca, matou cerca de 360 toneladas de peixes.