Los científicos publican el primer atlas genómico global de la vida microscópica de los lagos

Un equipo internacional de investigación ha publicado el primer atlas genómico global de los organismos microscópicos que se encuentran en lagos y embalses, informó Phys.org el 7 de octubre. El equipo analizó 3.400 conjuntos de datos de ADN de 362 lagos y embalses de 28 países de todos los continentes. Los hallazgos se publicaron en Nature Communications.

Los investigadores reconstruyeron casi 20.000 genomas mitocondriales de unas 3.660 especies, informó Phys.org. Las mitocondrias son las estructuras dentro de las células que producen la mayor parte de su energía. En varios grupos de algas y organismos relacionados, el equipo identificó entre seis y más de 20 veces más especies que las que figuran actualmente en la principal base de datos genómica de referencia del mundo.

Menos de uno de cada 20 genomas pudo asignarse a un género conocido, un grupo de clasificación superior a la especie, y unas 750 especies no pudieron emparejarse con ningún grupo conocido, según el estudio. «Esto demuestra lo grandes que siguen siendo las lagunas en nuestro conocimiento», afirmó el autor principal, Lucas Serra Moncadas. Dijo que gran parte de la biodiversidad que mantiene el funcionamiento de los lagos ha permanecido oculta y nunca se ha documentado.

Adrian-Stefan Andrei, jefe del grupo de Evogenómica Microbiana de la Estación Limnológica de la Universidad de Zúrich, dijo que un alga inofensiva y su pariente tóxica pueden parecer idénticas bajo el microscopio, y que su ADN probablemente contiene la clave para distinguirlas. El método utilizado en el estudio comienza con una muestra de agua. El agua se filtra y todo el ADN atrapado en el filtro se lee de una vez en un proceso llamado secuenciación, según Phys.org. Después, una herramienta de aprendizaje automático identifica el ADN de las mitocondrias, cuyo genoma es pequeño y generalmente cambia más rápido a lo largo del tiempo evolutivo que el ADN del núcleo celular.

El equipo estableció un umbral claro para que las especies puedan identificarse de manera consistente en distintos lagos, estaciones y estudios, informó Phys.org. Según el informe, el atlas sienta las bases para una monitorización más rápida y precisa de los lagos.

Durante décadas, estos organismos se han monitorizado contándolos uno a uno bajo el microscopio mediante un método desarrollado en 1958, informó Phys.org. El proceso es lento, depende de conocimientos especializados cada vez más escasos y tiene un importante punto ciego, según el informe. En 2022, una floración de una microalga tóxica en el río Óder, en la frontera germano-polaca, mató a unas 360 toneladas de peces.